GnomeでBeep音を消す

Gnomeメニューの
「システム」->「設定」->「ハードウェア」->「サウンド」から、
"ビープ音"タブから"システムのビープ音を有効にする"のチェックを
外すことで、ビープ音を消すことができた。

Gnomeターミナルも同じようにプロファイルの設定で、
"端末ベルを鳴らす"チェックを外せば鳴らなくなる。